助理医师证弄丢了

可以。证书丢了可以补，只是不能办业务了，不代表你失去了资格。就好比你身份证丢了，并不代表你不是人了，只不过需要身份证的业务没法办了而已。但是要注意的是，助理医师在城市里本来就没有独立行医的资格。并且你也只能在原来注册的机构里面行医，不可以到别的机构行医。如果你以证件丢失为理由不办理变更注册就到别家机构行医，是不行的。

尽量是到相关部门补一下助理资格证

按照正常流程，医师在取得执业医师资格之后，在领取执业医师证的同时，负责发放执业医师证的主管部门，应该先收回你的助理执业医师证，然后再给你发执业医师证。如果是你在还没有拿到执业医师证的时候，丢掉了助理执业医师证，那就需要在当地的报纸上刊登声明作废的公告，再领取执业医师证的时候向领取部门说明情况就可以了。