单位扣押执业药师注册

不是。可能是你的职业药师证是不是由公司出资来让你去考试的。如果是由公司出资的，那么你就需要把这部分的钱，交到公司。这样子的话，公司就需要把执业药师证归还给你。劳动法有规定，企业是不得随意扣押员工的证件的，如果公司执意要求你的执业药师证的话，你可以收取他的服务费。

申请劳动仲裁就可以了

既然已经注册在这个公司，没有合同也已经构成劳动雇佣关系；并且你可以追究他们未签合同，未支付社会保险的法律责任；建议向原公司提出书面辞呈，一个月后自动解除劳动合同；若依然不肯交出注册证，可以申请劳动仲裁。

既然没有合同那就好办了，你挂失原先公司扣押的注册证，然后重新办理一个。