单位扣留执业医师证

不合法，医生行医执照是个人的合法手续。任何单位不得扣留

对你的问题没有完全明白。不知道是什么证书，为什么要找中介挂靠呢，别别的公司取走，有你的委托书吗，就是你委托中介挂靠的委托书，你签字的。如果没有，直接和中介说，赶紧拿回来，没有你的委托书就让别的公司取走属于违法行为，可以到当地的劳动仲裁机构或者法律部门求助